Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms