Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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C11orf40Q8WZ69 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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C11orf40Q8WZ69 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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C11orf40Q8WZ69 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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