Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHIPQ8WWQ0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms