Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms