Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC148Q8NFR7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms