Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms