Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms