Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP1Q8N474 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms