Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms