Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms