Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3BQ7Z3V4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms