Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS62

COLCA1, Colorectal cancer-associated protein 1, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA1Q6ZS62 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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COLCA1Q6ZS62 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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COLCA1Q6ZS62 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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COLCA1Q6ZS62 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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COLCA1Q6ZS62 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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COLCA1Q6ZS62 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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COLCA1Q6ZS62 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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COLCA1Q6ZS62 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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COLCA1Q6ZS62 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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COLCA1Q6ZS62 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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COLCA1Q6ZS62 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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