Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms