Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms