Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms