Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL5Q6EMB2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms