Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms