Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms