Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms