Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms