Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDGFL1Q5TGJ6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms