Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms