Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms