Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms