Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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