Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COX19Q49B96 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COX19Q49B96 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms