Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms