Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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