Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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