Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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