Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms