Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms