Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPEGQ15772 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms