Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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