Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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