Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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