Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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