Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX2Q14781 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX2Q14781 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms