Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GINS1Q14691 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GINS1Q14691 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GINS1Q14691 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GINS1Q14691 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GINS1Q14691 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GINS1Q14691 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS1Q14691 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms