Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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