Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLINT1Q14677 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLINT1Q14677 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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