Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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