Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms