Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms