Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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IRF5Q13568 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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IRF5Q13568 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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IRF5Q13568 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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IRF5Q13568 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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IRF5Q13568 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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IRF5Q13568 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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IRF5Q13568 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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IRF5Q13568 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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IRF5Q13568 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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