Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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