Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.913e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 LAMA5-204ENST00000462415 585 ntTSL 220.25■□□□□ 0.837e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SQLE-205ENST00000521232 711 ntTSL 320.6■□□□□ 0.894e-32■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 PKN1-205ENST00000586039 686 ntTSL 219.54■□□□□ 0.726e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 NDUFS7-217ENST00000591358 3743 nt14.56□□□□□ -0.084e-13■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 POLR2I-204ENST00000586789 993 ntTSL 523.44■■□□□ 1.341e-9■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 POLR2I-203ENST00000586439 744 ntTSL 523.33■■□□□ 1.331e-9■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.51e-9■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 POLR2I-206ENST00000589591 542 ntTSL 216.91■□□□□ 0.31e-9■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 POLR2I-205ENST00000589069 582 ntTSL 216.75■□□□□ 0.271e-9■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 POLR2I-202ENST00000585842 368 ntTSL 214.06□□□□□ -0.161e-9■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 POLR2I-207ENST00000592962 493 ntTSL 213.39□□□□□ -0.271e-9■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TRMT2A-213ENST00000480339 762 ntTSL 215.09■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.055e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.915e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.115e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.015e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.025e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.115e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.135e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.074e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 NDUFB8-204ENST00000464651 390 ntTSL 212.44□□□□□ -0.422e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TARBP2-214ENST00000550147 1855 ntTSL 1 (best)24.83■■□□□ 1.575e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.515e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TARBP2-209ENST00000548971 1493 ntTSL 523.94■■□□□ 1.425e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.265e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TARBP2-213ENST00000549679 1466 ntTSL 517.35■□□□□ 0.375e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TARBP2-211ENST00000549572 1514 ntTSL 517.32■□□□□ 0.365e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.365e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TARBP2-215ENST00000550407 1132 ntTSL 517.23■□□□□ 0.355e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.185e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 KIF1B-205ENST00000377093 7565 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.671e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.91e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.911e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.281e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.429e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.279e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.465e-9■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.96e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 RCCD1-208ENST00000557266 2110 ntTSL 1 (best)24.91■■□□□ 1.586e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.056e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.717e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.017e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.67e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 PKN1-206ENST00000586237 529 ntTSL 517.71■□□□□ 0.435e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.55e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.085e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.255e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.295e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.535e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SLC38A5-211ENST00000615300 797 ntTSL 318.01■□□□□ 0.472e-9■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 INTS1-203ENST00000479671 245 ntTSL 223.15■■□□□ 1.32e-10■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.175e-10■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.977e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 FKBP3-204ENST00000557324 643 ntTSL 521.08■□□□□ 0.972e-10■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.957e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.937e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.835e-10■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.747e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.77e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 EMC8-205ENST00000597291 1826 nt18.54■□□□□ 0.565e-10■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.477e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.37e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 DPM2-203ENST00000470181 928 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.183e-11■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.12e-10■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TEX264-211ENST00000463857 3937 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.217e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 NFYC-219ENST00000496608 1965 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 EMC8-203ENST00000595980 556 ntTSL 213.48□□□□□ -0.255e-10■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 INTS1-205ENST00000483196 386 ntTSL 512.57□□□□□ -0.42e-10■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 NFYC-207ENST00000414185 677 ntTSL 311.82□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 NFYC-213ENST00000447388 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.592e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 NFYC-201ENST00000308733 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 NFYC-203ENST00000372652 2363 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.672e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.172e-10■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 THOC2-219ENST00000497887 768 ntTSL 37.39□□□□□ -1.232e-10■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.315e-9■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TNNT1-217ENST00000593194 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.07■■□□□ 1.124e-8■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TNNT1-207ENST00000587089 880 ntTSL 519.49■□□□□ 0.714e-8■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.414e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.642e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 PSMB10-203ENST00000570985 591 ntTSL 218.4■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 PSMB10-204ENST00000574576 539 ntTSL 318.06■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 AC040162.1-201ENST00000575231 5685 ntTSL 215.29■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.873e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.851e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 521.29■■□□□ 11e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.631e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 218.7■□□□□ 0.581e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SLC39A3-206ENST00000590875 572 ntTSL 224.83■■□□□ 1.579e-9■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.862e-7■■■□□ 17.7
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