Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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