Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
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