Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms